基于丹参基因组的蛋白磷酸酶2C家族的系统分析

• 作者: 宋经元 徐志超 浦香东
• 来源期刊: 中国现代中药
• 关键词: 丹参 蛋白磷酸酶 PP2C 逆境胁迫
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 652-657
• 页数: 6页
• 字数: 3578字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13313/j.issn.1673-4890.20180312001

摘要

目的:基于全基因组策略系统解析药用植物丹参的蛋白磷酸酶2C家族成员,为研究丹参逆境胁迫响应的分子机制奠定基础.方法:采用BLASTP序列比对、系统发育树构建、基因表达分析等方法解析丹参PP2C亚家族成员、基因结构以及差异表达图谱.结果:丹参基因组共注释到83个PP2C家族成员,在高等植物中保守存在;系统进化分析将PP2C家族分为13个亚家族(PP2CA-PP2CL,A、B、C、D、E、F1、F2、G、H、I、J、K、L),结构域高度保守;PP2CA亚家族基因启动子含有多种逆境胁迫应答的顺式作用元件,大部分PP2CA基因表达显著响应逆境胁迫信号.结论:本实验系统研究丹参PP2C基因的结构、在不同组织部位的表达及逆境胁迫下的响应,为揭示丹参响应生物或非生物胁迫的分子机制研究提供理论依据.