大蒜半胱氨酸合成酶的 mRNA 表达及生物信息学分析

• 作者: 孙毅 张欢欢 杜建中 王亦学 郝曜山 郭天璐
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 大蒜 半胱氨酸合成酶 荧光定量 PCR
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 96-102
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.08.015

摘要

半胱氨酸合成酶的产物半胱氨酸是植物中含硫氨基酸的重要来源，大蒜中含硫氨基酸丰富，研究大蒜半胱氨酸合成酶的性质及生物学功能以明确其在大蒜硫代谢中的作用。利用生物信息学技术分析从 NCBI 数据库中获得的3个大蒜的半胱氨酸合成酶基因（AsGCS2、AsGCS3和 AsGCS4）的开放阅读框，预测其蛋白序列、分子量大小、蛋白质特性、亚细胞定位、系统进化等特征；通过荧光定量 PCR 分析了3个半胱氨酸合成酶的组织表达特性。结果显示，AsGCS2、AsGCS3和 AsGCS4的开放态读码框长度分别为1152 bp、1296 bp 和1236 bp ；其编码蛋白的理论相对分子量分别为40.6 kD、34.1 kD 和36.1 kD。AsGCS2被亚细胞定位于叶绿体中，而 AsGCS3和 AsGCS4均被定位于细胞质中。氨基酸比对结果表明，AsGCS2与 AsGCS3相似度为70%，与AsGCS4相似度为59%；而 AsGCS3与 AsGCS4相似度为68%。进化分析图表明，AsGCS2属于 Bsas2亚家族，AsGCS3属于 Bsas1亚家族，AsGCS4属于 Bsas6亚家族。荧光定量 PCR 结果表明，大蒜不同 CSase 的组织特异性是不同的，AsGCS2在叶中表达量最高， ASGCS3在根中表达量最高，而 ASGCS4在叶和根中都有较高的表达量。3个半胱氨酸合成酶基因分别属于不同的 Bsas 亚家族，它们的组织表达特性也不相同，它们在大蒜不同组织中的半胱氨酸合成途径中起作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜建中	山西省农业科学院生物技术研究中心	42	576	15.0	22.0
2	郝曜山	山西省农业科学院生物技术研究中心	30	226	10.0	13.0
3	王亦学	山西省农业科学院生物技术研究中心	23	149	9.0	11.0
4	孙毅	山西省农业科学院生物技术研究中心	143	2581	25.0	44.0
5	郭天璐	山西大学生物工程学院	3	9	2.0	3.0
6	张欢欢	山西省农业科学院生物技术研究中心	13	29	3.0	4.0