水稻矮秆基因iga-1的序列变异和表达分析

• 作者: 刘永柱 卢苏龙 王慧 郭涛 陈志强 陈立凯
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻 矮秆基因 缺失突变 G蛋白α亚基 iga-1
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q754|Q789
• 字数: 4920字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2016.01.0001

摘要

该研究以水稻矮秆突变体cha-2为材料,对控制其表型性状的iga-1基因进行候选基因筛选,利用基因注释数据库对定位区间进行候选基因预测,通过ORF及其上下游调控区域的测序、序列比对及关键元件分析进行序列变异研究,半定量PCR检测目标基因的表达模式,明确其在基因序列、表达模式的变异,探讨其分子遗传调控机理.结果显示:(1)在隐性核基因iga-1精细定位基础上预测得到3个ORF,其中2个编码dnaJ分子伴侣(含有dnaJ结构域的蛋白),分别是LOC_Os05g26902和LOC_Os05g26926;另外1个为已克隆的水稻矮秆基因RGA1(LOC_Os05g26890).(2)ORF序列分析表明矮秆突变体cha-2与野生型仅在RGA1基因座存在SNP变异,但未造成氨基酸编码的改变.(3)表达模式分析发现,矮秆突变体cha-2的RGA1基因在种子萌发期、二叶期、四叶期和分蘖期等4个发育时期均不表达,且在‘中花11’、‘石狩白茅’的遗传背景下稳定遗传,均显现出失活状态,初步确定RGA1为iga1的候选基因.(4)对RGA1基因上游和下游调控转录关键区进行测序结果表明,突变体cha-2存在865 bp的大片段缺失,包括第1外显子、部分第1内含子和转录起始上游区域.研究推断,突变体cha-2的矮秆基因iga-1正是没有活性的RGA1基因,其转录关键区域的大片段缺失,导致无法正常转录表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王慧	华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心	64	748	15.0	25.0
2	陈志强	华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心	51	592	14.0	22.0
3	郭涛	华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心	41	340	12.0	16.0
4	刘永柱	华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心	40	350	11.0	16.0
5	陈立凯	华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心	6	26	3.0	5.0
6	卢苏龙	华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心	1	1	1.0	1.0