肺炎克雷伯菌质粒pNDM-LJ的高通量测序分析

• 作者: 唐海玲 杨羚 裘宇容 陈定强
• 来源期刊: 实用医学杂志
• 关键词: 肺炎克雷伯菌 pNDM-LJ blaNDM-1基因 碳青霉烯酶
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 706-709
• 页数: 4页
• 字数: 3311字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5725.2016.05.006

摘要

目的：通过对肺炎克雷伯菌质粒pNDM-LJ的高通量测序分析，研究其与肺炎克雷伯菌耐药的相关性。方法：利用Illumina Miseq 高通量测序平台进行测序，然后用Edena 软件拼接测序数据，再利用RAST网上工具将拼接得到的contigs 进行注释，并用BLAST网上工具进行分析。结果：pNDM-LJ 为54 kb 大小的环状质粒，GC含量约为49％，预测编码52个功能基因，在不相容群分类中属于IncX3群质粒。该质粒与已知的IncX质粒序列有较高的相似性，blaNDM-1基因所在的基因环境比较复杂，推测其是由多个转座事件共同构建的。在pNDM-LJ中，blaNDM-1基因的5′端和3′端分别与ISAba125和IS26两种插入序列相连，形成大小约为10．8 kb的转座子样结构。结论：pNDM-LJ质粒携带碳青霉烯类耐药基因blaNDM-1，可能对我国的广泛传播blaNDM-1基因发挥重要作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	裘宇容	南方医科大学南方医院检验科	149	810	14.0	16.0
2	陈定强	广州医科大学附属第一医院检验科	31	102	6.0	8.0
3	杨羚	广州医科大学附属第一医院检验科	7	27	3.0	5.0
4	唐海玲	广州医科大学附属第一医院转化医学实验室	3	7	2.0	2.0