肺炎克雷伯菌质粒pIMP26_DQ49的高通量测序分析

• 作者: 吴爱武 唐海玲 陈定强 黄丽燕
• 来源期刊: 广东医学
• 关键词: 肺炎克雷伯菌 碳青霉烯酶 pIMP26-DQ49 blaIMP-26
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 71-75
• 页数: 5页
• 字数: 3444字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-9448.2018.01.021

摘要

目的 通过对肺炎克雷伯菌DQ49耐药质粒pIMP26_DQ49的测序及分析,研究其与肺炎克雷伯菌耐药的关系.方法 利用多位点序列分型技术(MLST)检测肺炎克雷伯菌DQ49的序列分型(ST),通过接合实验得到携带耐药基因blaIMP-26的质粒pIMP26_DQ49,利用Illumina Miseq 高通量测序平台对该质粒进行测序,得到的数据用Edena 软件拼接,并利用RAST网上注释工具对得到的质粒全序列进行注释,同时使用网上序列比对工具BLAST进行分析.结果 MLST分析该菌的ST型为新的ST型ST2460(基因型42-22-26-96-233-38-51);接合实验证明该质粒能通过接合转移进行传播;测序结果表明,pIMP26_DQ49属于质粒不相容群(Inc)中的IncN群,是大小为55179 bp的环状质粒,携带3个耐药基因,G+C含量为50.4%,预测编码52个功能基因.BLAST发现pIMP26_DQ49与已报道的pIMP_HZ1序列相似度高达99%,且携带的可移动基因元件也高度相似,其耐药基因环境包含可导致转座事件发生的IS903D、IS2、Tn2、Tn3、tnp、tnpA,以及能捕获和整合外源性基因的1类整合子基因intl1.结论 质粒pIMP26_DQ49携带超广谱β-内酰胺酶基因blaTEM-1、喹诺酮耐药基因qnrS1和金属型碳青霉烯酶基因 blaIMP-26,其存在可能对相应的耐药基因在肠杆菌科细菌中的传播发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴爱武	广州医科大学金域检验学院	35	87	6.0	6.0
2	陈定强	广州医科大学附属第一医院检验科	31	102	6.0	8.0
3	唐海玲	广州医科大学附属第一医院转化医学实验室	3	7	2.0	2.0
4	黄丽燕	广州医科大学附属第一医院呼吸疾病国家重点实验室	2	4	1.0	2.0