双峰驼重链抗体组库的基本特征研究

• 作者: 刘晓 卢汝学 张伟 张长江 李新洋 段小波 谭文
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 双峰骆驼 重链抗体 抗体组库
• 年，卷（期）: 2016,（22）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 4207-4212
• 分类号: Q524+.4|Q751
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2016.22.002

摘要

目的:利用二代高通量测序技术,了解双峰骆驼循环B细胞重链抗体(HCAbs)组库的组成和基本特征.方法:通过分离骆驼外周血单核细胞(PBMC),提取mRNA,利用多重PCR和Illumina Mi-seq高通量测序技术对三头双峰骆驼的重链抗体可变区进行深度测序,分析了重链抗体组库V、J基因组成、重排时末端基因删除数和V-J基因配对率,以及CDR3的长度、香农多样性指数(Shannon index)、氨基酸组成分布等基本特征.结果:鉴定出平均每头骆驼130000条有效数据和67561条独特CDR3序列,HCAbs含量较高的V基因为IGHV1 S45、IGHV1S50和IGHV1S52,J基因为IGHJ4和IGHJ6,所对应的V-J基因配对含量大于40％;CDR3的长度主要分布在10-30个氨基酸之间,含量较高的氨基酸为丙氨酸、甘氨酸和半胱氨酸;CDR3区域70％以上的平均长度为20个氨基酸长度,其中V基因长度为3bp,J基因长度分布在1-18 bp.结论:双峰骆驼B细胞重链抗体组库由巨大的、不均匀分布(以少数VJ基因克隆占大多数)的和具有高度多样性的多克隆抗体构成,较长CDR3和富含丙氨酸、甘氨酸和半胱氨酸是HCAbs的重要特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张伟		1	1	1.0	1.0
2	李新洋		1	1	1.0	1.0
3	卢汝学		2	6	1.0	2.0
4	刘晓		1	1	1.0	1.0