药用多孔菌DNA条形码鉴定研究

• 作者: 李志明 李西文 汤欢 苏燕燕 雷志勇
• 来源期刊: 世界中医药
• 学科: 医学
• 关键词: 药用多孔菌 DNA条形码 真菌 ITS
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 专题——现代生物学技术在中药资源研究中的应用
• 页码范围: 771-776
• 页数: 6页
• 分类号: R282.5
• 字数: 3948字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-7202.2016.01.005

摘要

目的:筛选采用DNA条形码技术鉴定药用多孔菌的有效条形码及该方法的可行性.方法:对29种药用多孔菌的69份样品进行DNA提取,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增ITS序列并进行双向测序,去除低质量区和引物区,得到ITS序列,通过BLAST比对及基于K2P遗传距离构建系统聚类NJ树开展ITS鉴定效率评价.结果:经过优化的DNA提取方法,可对所有样品成功提取到足量DNA,PCR扩增产物测序并经过序列拼接剪切后均能得到高质量ITS序列;物种内ITS最大遗传距离均远小于物种种间最小遗传距离;基于GenBank数据库进行BLAST比对,鉴定效率达到100％;基于K2P遗传距离构建NJ树,结果显示相同物种均聚为一支.结论:DNA条形码技术可以对多孔菌进行快速准确鉴定,ITS序列可作为药用多孔菌有效候选DNA条形码.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李西文	中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性检测评估北京市重点实验室	53	441	12.0	18.0
2	汤欢	中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性检测评估北京市重点实验室	3	18	3.0	3.0
3	雷志勇		2	13	2.0	2.0
4	苏燕燕	中国中医科学院中药研究所中药鉴定与安全性检测评估北京市重点实验室	2	5	1.0	2.0
5	李志明		1	5	1.0	1.0