基于宏基因组学16S rDNA测序对烟草根际土壤细菌群落组成分析

• 作者: 于建军 占俊文 常安然 张耸 李佳 王佩雯 魏登辉
• 来源期刊: 中国农业科技导报
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 根际土壤 细菌 宏基因组学 冗余度分析
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术 生命科学
• 页码范围: 43-50
• 页数: 8页
• 分类号: S572
• 语种: 中文
• DOI: 10.13304/j.nykjdb.2016.377

摘要

为了研究烟草根际土壤细菌多样性,了解其细菌群落的组成和结构,从而为健康植烟土壤生态系统的构建和保持提供理论依据和指导.以2014年四川凉山州健康烟株现蕾期根际土壤为研究样本,利用Illumina平台Miseq高通量测序技术对烟草根际土壤细菌16S rDNA进行高通量测序分析.结果表明:烟草根际土壤微生物多样性水平较高,不同样品间主要菌落分布结构相对稳定.在门分类水平上,共检测分类25个菌门,其中变形菌门占有明显优势(39.04％～53.71％),其次为拟杆菌门、酸杆菌门、疣微菌门;在属分类水平上,共检测分类576类菌属,鞘脂单胞菌属、Flavisolibacter、Ohtaekwangia为烟草根际土壤细菌明显优势菌属.大部分主要菌群之间存在明显正相关关系,对烟草根际土壤细菌影响较大的环境因子为土壤速效氮、含水量和pH.运用宏基因组学16S rDNA测序技术获取的烟草根际土壤细菌信息较为丰富,为健康植烟土壤机制研究提供新的理论参考.