秀丽线虫基因组中的回文序列分布

• 作者: 冯芬 刘国庆
• 来源期刊: 内蒙古科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 回文序列 相对丰度 GC含量 转录因子结合位点
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 页码范围: 73-79
• 页数: 7页
• 分类号: Q6
• 字数: 5226字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16559/j.cnki.2095-2295.2017.01.017

摘要

回文序列在基因组既可以作为基因表达调控的模体,也能引起基因组的不稳定而导致疾病.本文通过全基因组范围的回文识别,揭示回文在线虫基因组上的总体分布模式,并结合回文丰度和分布特征,探讨回文的生物学功能.结果发现:(1)基因组不同功能区域(如编码区、内含子、基因间区)中,回文在内含子中分布最多,基因间区次之,在编码区分布最少;(2)回文的相对丰度随着回文长度的增加而增加,这反映了基因组对不同长度回文的使用选择性;(3)总体而言回文GC含量随着回文长度的增加而降低,而且在不同的基因组区域(编码区、内含子和基因间区)中回文的GC含量有很大差异;(4)搜索转录因子结合位点模体与回文模体,发现转录因子结合位点富含模体与回文模体,且转录因子结合位点模体中有很明显的回文模体,表明回文可能作为转录因子结合模体而调控转录.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘国庆	内蒙古科技大学数理与生物工程学院	12	9	2.0	3.0
5	冯芬	内蒙古科技大学数理与生物工程学院	1	0	0.0	0.0