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摘要:
【目的】阐明荞麦Fagopyrum中3个种子蛋白基因序列的特征及其在种子发育过程中的作用,为探讨荞麦种子发育过程分子机制提供理论依据。【方法】利用本地Perl程序、BLASTP、MEGA6、PLANTCARE等,分析了荞麦3个种子蛋白基因(13S球蛋白基因、11S球蛋白基因和谷蛋白基因)序列及其编码蛋白质的进化关系,预测启动子区域的顺式作用元件。通过荧光定量 PCR 技术分析3个基因在甜荞 F. esculentum、苦荞 F. tataricum 和金荞 F. cymosum种子发育过程中的表达情况。【结果】13S球蛋白基因含有4个外显子和3个内含子,蛋白序列长515 aa,与苦荞中的一个13S球蛋白(GeneBank登录号:ABI32184.1)仅有6个氨基酸不同,推测二者为同一个基因,在苦荞灌浆中期表达量最高;11S球蛋白基因含有8个外显子和7个内含子,蛋白序列长914 aa,与欧洲慈姑中的一个11S球蛋白(GeneBank登录号:ABB77213.1)亲缘关系最近,在苦荞灌浆中期表达量最高;谷蛋白基因含有3个外显子和2个内含子,蛋白序列长355 aa,与甜菜中的一个B5型谷蛋白(GeneBank登录号:XP_010683769.1)亲缘关系最近,在甜荞灌浆中期表达量最高。3个基因的启动子区域均含有大量响应逆境和激素的顺式作用元件,以及在胚乳中表达所需的顺式作用元件。【结论】本研究获得了1个13S球蛋白基因序列、1个11S球蛋白基因序列和1个谷蛋白基因序列,这3个基因可能在胚乳中优势表达,并且参与到逆境胁迫和激素响应的过程中;灌浆中期是种子蛋白积累的关键时期,3个基因均在这一时期大量表达,这为后续进一步研究基因功能奠定了基础。
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内容分析
关键词云
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文献信息
篇名 荞麦3个种子蛋白基因的序列和表达分析
来源期刊 华南农业大学学报 学科 农学
关键词 荞麦 种子蛋白 灌浆期 基因表达
年,卷(期) 2017,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 23-30
页数 8页 分类号 S517
字数 5626字 语种 中文
DOI 10.7671/j.issn.1001-411X.2017.01.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陈庆富 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心 170 1308 15.0 28.0
2 石桃雄 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心 25 59 4.0 6.0
3 梁成刚 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心 13 29 2.0 5.0
4 黄娟 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心 29 83 5.0 8.0
5 邓娇 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心 17 18 3.0 3.0
6 张启迪 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心 3 6 1.0 2.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
荞麦
种子蛋白
灌浆期
基因表达
研究起点
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研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
华南农业大学学报
双月刊
1001-411X
44-1110/S
大16开
广州五山华南农业大学学报编辑部
1959
chi
出版文献量(篇)
2705
总下载数(次)
5
总被引数(次)
47288
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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