鼠隐藏管状线虫烯醇化酶基因的克隆与序列分析

• 作者: 张延忠 李俊鹏 王平 王晓炜 程田 谢天柱 陈宁 鲁艺 龚振兴
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鼠隐藏管状线虫 烯醇化酶 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 寄生虫
• 页码范围: 50-58
• 页数: 9页
• 分类号: S852.731
• 字数: 5612字
• 语种: 中文

摘要

为获得鼠隐藏管状线虫(Syphacia obvelata)烯醇化酶结构及其功能,采用同源克隆方法结合RACE技术克隆获得了烯醇化酶基因cDNA序列,并对其进行了序列分析.测序结果显示,扩增获得的鼠隐藏管状线虫烯醇化酶基因大小序列为1603 bp,包含全长为1311 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)序列,共编码436个氨基酸,推导分子量为47.428 kDa.序列分析结果显示,鼠隐藏管状线虫烯醇化酶含有10个丝氨酸激酶磷酸化位点、3个苏氨酸激酶磷酸化位点和4个酪氨酸激酶磷酸化位点,1个潜在的跨膜螺旋结构,无信号肽剪切位点;在亚细胞水平,预测其主要定位于胞浆;二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,其中α-螺旋占34.86％,无规则卷曲占30.50％,延伸链占24.08％,β-转角占10.55％.Swiss-Model模建的3D结构显示,鼠隐藏管状线虫烯醇化酶为一“哑铃”样结构,包含氨基端和羧基端两个结构域,结构域之间为Linker区.每个结构域由多个α-螺旋、β-折叠和卷曲所构成桶形结构,催化中心和Mg2上结合位点位于桶形结构的中心.本研究结果为鼠隐藏管状线虫烯醇化酶基因的功能研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王晓炜		37	112	7.0	8.0
2	鲁艺		12	20	3.0	4.0
3	王平		35	99	5.0	8.0
4	李俊鹏		23	78	5.0	7.0
5	陈宁		6	13	2.0	3.0
6	程田	华南农业大学兽医学院	9	28	3.0	4.0
7	张延忠		5	10	2.0	3.0
8	龚振兴	中国农业科学院兰州兽医研究所	4	11	2.0	3.0
9	谢天柱		7	14	2.0	3.0