紫云英实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

• 作者: 庄俐 张贤 徐昌旭 曹凯 曹卫东 李增强 王建红
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 紫云英 实时荧光定量PCR 内参基因 筛选
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 研究资源与技术改进
• 页码范围: 1356-1365
• 页数: 10页
• 分类号: S551+.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2017.08.016

摘要

在实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析中,选择合适的内参基因是保证检测结果准确性的先决条件.紫云英(Astragalus sinicus)基因组信息匮乏,内参基因的选择尤为重要.本研究筛选了7个持家基因GAPDH、Cons7、ELF1B、Tubulin、Ubiquitin E2、Actin A以及Actin 20,利用qRT-PCR技术研究持家基因的表达情况,并采用GeNorm、NormFinder和Best Keeper软件,分析其在紫云英不同组织(根、茎、叶、花和荚果)和不同非生物胁迫(干旱胁迫、涝胁迫、盐胁迫、脱落酸(abscisic acid,ABA)胁迫)条件下叶片中的表达稳定性.结果表明,7种内参基因在紫云英不同的组织器官和不同的胁迫处理分析中,稳定性表现不尽相同.Cons7在盐胁迫和涝胁迫处理下最稳定,Tubulin、Actin 20和GAPDH分别在不同组织、AB处理和干旱胁迫下表达最稳定.因此,采用qRT-PCR分析紫云英不同器官组织中的基因表达差异时,可选择Tubulin作为校正内参基因;而比较脱落酸处理、盐胁迫和涝胁迫处理时,可选择Cons7作为校正内参基因;比较干旱胁迫处理时,选择GAPDH作为校正内参基因.本研究结果为研究紫云英不同生理过程中目的基因表达提供了稳定可靠的内参基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐昌旭	江西省农业科学院土壤肥料与资源环境研究所	27	319	10.0	17.0
2	王建红	浙江省农业科学院环境资源与土壤肥料研究所	45	512	13.0	21.0
3	庄俐	浙江省农业科学院环境资源与土壤肥料研究所	8	45	4.0	6.0
4	曹凯	浙江省农业科学院环境资源与土壤肥料研究所	24	156	8.0	11.0
5	张贤	浙江省农业科学院环境资源与土壤肥料研究所	21	146	8.0	11.0
6	李增强	浙江省农业科学院环境资源与土壤肥料研究所	6	45	4.0	6.0