铁皮石斛可溶性酸性转化酶基因克隆与表达分析

• 作者: 卢丙越 孟衡玲 张薇 苏一兰 薛春丽
• 来源期刊: 华南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 铁皮石斛 酸性转化酶 基因克隆 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 页码范围: 81-85
• 页数: 5页
• 分类号: S828
• 字数: 4385字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7671/j.issn.1001-411X.2017.02.015

摘要

【目的】克隆铁皮石斛Dendrobium officinale可溶性酸性转化酶基因SAI，分析该基因生物学信息及时空表达特异性。【方法】基于同源序列克隆铁皮石斛SAI基因cDNA全长，采用生物信息学方法进行序列分析，并采用qRT-PCR进行组织特异性表达分析。【结果】铁皮石斛SAI基因全长为1595 bp，cDNA编码区1368 bp，Genbank登录号为KU598852。该基因编码455个氨基酸，蛋白相对分子质量为50700。 NCBI BLASTx分析表明，该基因氨基酸序列与柑橘Citrus unshiu酸性转化酶基因、甜橙C．sinensis酸性β-呋喃果糖苷酶基因序列相似性最高，达77％，与其他植物酸性转化酶基因的相似性均高于68％。聚类分析表明，铁皮石斛SAI基因与玉米Zea mays液泡转化酶基因、甘蔗Saccharum officinarum SAI基因亲缘关系最近。该基因编码的蛋白质属于非跨膜结构的亲水性热稳定蛋白，定位于液泡中。 SAI基因在2年生铁皮石斛的茎中表达量最高，3年生的叶中表达量最低。【结论】成功克隆铁皮石斛液泡酸性转化酶基因，该基因在铁皮石斛不同组织不同生育时期的表达量差异较大。