利用表达谱芯片数据筛选不同表达丰度的内参基因

• 作者: 周宇荀 周梁良 徐福意 晁天柱 李凯 肖君华 胡世贤 陆佳涛
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 内参基因 表达谱芯片 实时荧光定量PCR geNorm软件
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 8-13
• 页数: 6页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 2812字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2017.01.002

摘要

目的 基于表达谱芯片的检测结果,筛选多个内参基因,用于小家鼠肝脏组织中具有不同表达丰度基因的定量检测.方法 应用表达谱芯片技术,完成小鼠肝脏组织的表达谱检测;依据基因表达丰度将基因分为3组,并进一步通过变异系数(coefficient of variation,CV)组内筛选候选内参基因;采用实时荧光定量PCR技术(real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)和geNorm软件确定内参基因.结果 表达谱芯片成功采集超过60000个小鼠肝脏组织中转录本的表达量数据,并将之分为低、中、高3个组合.最终筛选了低表达Casp2和Lr?rc14、中表达Nrd1和Trpc4ap、高表达Atp5a1和Clu,共6个内参基因.结论 基于表达谱芯片数据筛选的6个内参基因,可适用于qPCR技术准确定量小家鼠肝组织转录组中不同表达丰度基因的表达量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖君华	东华大学生物科学与技术研究所	58	137	7.0	9.0
2	李凯	东华大学生物科学与技术研究所	58	122	6.0	9.0
3	周宇荀	东华大学生物科学与技术研究所	53	102	6.0	9.0
4	晁天柱	东华大学生物科学与技术研究所	14	35	4.0	5.0
5	陆佳涛	东华大学生物科学与技术研究所	2	0	0.0	0.0
6	徐福意	东华大学生物科学与技术研究所	8	6	1.0	2.0
7	胡世贤	东华大学生物科学与技术研究所	4	0	0.0	0.0
8	周梁良	东华大学生物科学与技术研究所	2	0	0.0	0.0