鹅Caspase-1基因的克隆与序列分析

• 作者: 刘文俊 田允波 许丹宁 邱金辉 阳佑天 黄运茂
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鹅 半胱氨酸蛋白酶-1 基因克隆 序列分析 同源性分析 分子进化
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 144-150
• 页数: 7页
• 分类号: S835
• 字数: 4467字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2017.12.022

摘要

为系统了解鹅炎症系统,用Trizol法提取马岗鹅脾脏总RNA,采用兼并引物RT-PCR方法克隆了马岗鹅Caspase-1基因并进行了系统的生物信息学分析.测序结果显示,go-Caspase-1基因完整ORF区长813 bp,编码270个氨基酸(GenBank 序列号为MG463109).同源性分析显示,go-Caspase-1基因序列与鸭、鸡等禽类的同源性较高,与其他物种的差异较大.蛋白质功能结构域分析显示,不同物种间Caspase-1蛋白的Caspase结构域高度相似.蛋白三维结构预测比较显示,go-Caspase-1蛋白空间结构与鸡和人的Caspase-1主体结构相似.