基于p23基因的野生柑橘和栽培柑橘上衰退病毒分离株间的遗传特征分析

• 作者: 周常勇 易龙
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 野生柑橘 栽培柑橘 柑橘衰退病毒 p23基因 遗传特征
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 828-834
• 页数: 7页
• 分类号: S666
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20170035

摘要

[目的]比较分析野生柑橘与栽培柑橘上衰退病毒(CTV)分离株间的分子遗传特征,为深入解析CTV的遗传进化提供相关依据.[方法]运用RT-PCR对我国云南、广西、四川、湖南、江西等省(区)的11个野生柑橘上的CTV分离株和4个国内栽培甜橙及柚上的CTV强弱毒代表株分离株的p23基因进行扩增、测序,所获序列与GenBank收录的具有代表性的国外CTV分离株的相应基因序列进行比对分析.[结果]野生柑橘与国内外栽培柑橘上CTV分离株的p23基因序列相似率为87.7％～99.3％;密码子中碱基含量GC％＜AT％,密码子转换数多于颠换数,第3位的碱基替换数最多,其次为第1位,最少是第2位;非同义突变与同义突变的比值(dN/ds)小于1,表明p23基因在进化过程中承受着净化选择.系统聚类分析表明,来自于野生柑橘上的11个CTV分离株在构建的系统发育树中分属不同的簇支,与不同来源地具有较高相似性和较低遗传距离的栽培柑橘上的CTV分离株构成同一组群.[结论]野生柑橘与栽培柑橘上的CTV分离株在碱基含量、密码子转换和颠换率及非同义突变与同义突变比值(dN/ds)等遗传特征方面均表现出一致性,系统发育分析表明,野生柑橘上CTV分离株基于p23基因序列的聚类关系与其地理来源之间无明显相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周常勇	中国农业科学院/西南大学柑桔研究所	67	764	16.0	23.0
2	易龙	中国农业科学院/西南大学柑桔研究所	1	0	0.0	0.0