柑橘衰退病毒基因组的简单重复序列分布分析

• 作者: 李世访 王红清 谭钟扬 赵哲
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 柑橘衰退病毒 简单重复序列 植物病毒
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 237-242
• 页数: 6页
• 分类号: Q518.2
• 字数: 3456字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.03.13

摘要

柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)属于长线性病毒科(Closteroviridae),是目前已知植物病毒中基因组最大的病毒,其引起的柑橘衰退病对全世界的柑橘产业造成着严重影响.本文以在GenBank登录的32条全长CTV基因组序列为材料,分析简单重复序列(Simple Sequence Repeats,SSRs)在其基因组序列中的分布情况.研究结果显示,在所有的CTV基因组中均有SSRs的分布,SSRs重复次数较少,二型SSRs占主导地位,未在CTV基因组序列中发现五型和六型SSRs.在32条基因组全长序列中仅在5条序列中发现四型SSRs.这是首次以柑橘病毒为材料进行的SSRs分析研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李世访	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	50	364	11.0	16.0
2	王红清	中国农业大学农学与生物技术学院果树系	30	384	12.0	19.0
3	谭钟扬		12	21	3.0	4.0
4	赵哲	中国农业大学农学与生物技术学院果树系	2	3	1.0	1.0