藏羊源细粒棘球蚴抗原B亚单位2蛋白生物信息学分析及其结构和功能预测

• 作者: 付永 彭毛 朵红 李伟 沈秀英 牛建章 郭志宏 马青梅
• 来源期刊: 青海大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 藏羊源细粒棘球蚴 抗原B亚单位2蛋白 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 农业科学
• 页码范围: 6-10
• 页数: 5页
• 分类号: S852.7
• 字数: 2286字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13901/j.cnki.qhwxxbzk.2017.01.002

摘要

为进一步探索藏羊源细粒棘球蚴抗原B亚单位2蛋白(EgAgB8/2)功能,用DNAstar软件对EgAgB8/2重组基因序列进行分析并推算出其编码的氨基酸序列;通过蛋白分析系统Ex-PASY的在线软件ProtParam和Proscale,分析EgAgB8/2蛋白的物理和化学性质;用SignalP4.1软件对蛋白质信号肽进行预测.用TMHMM软件对EgAgB8/2蛋白的跨膜区进行分析.通过DNAstar分析EgAgB8/2蛋白质的二级结构.利用CBS分析系统上的BepiPred1.0b和DNAstar二者结合方式预测抗原表位.通过在线软件SWISS-MODEL预测三维结构.结果表明:EgAgB8/2重组基因335 bp的基因序列中,有一个273 bp开放阅读框,编码91个氨基酸.组成EgAgB8/2蛋白的有20种氨基酸,理论分子质量为10.35 ku,等电点为9.52,总平均亲水性为-0.247,蛋白总体亲水性较低,既含有信号肽序列又包括胞外区,结合两者的综合分析,确定EgAgB8/2蛋白抗原表位有:第21～27位,第47 ～ 48位,第82～ 88位.EgAgB8/2的结构和功能及其抗原表位的预测,为其在棘球蚴病的中间宿主免疫诊断方面的应用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李伟	青海大学畜牧兽医科学院	13	29	2.0	5.0
2	朵红	青海大学畜牧兽医科学院	9	6	1.0	2.0
3	付永	青海大学畜牧兽医科学院	12	7	1.0	2.0
4	沈秀英	青海大学畜牧兽医科学院	7	6	1.0	2.0
5	郭志宏	青海大学畜牧兽医科学院	13	31	3.0	5.0
6	牛建章	青海大学畜牧兽医科学院	10	2	1.0	1.0
7	彭毛	青海大学畜牧兽医科学院	3	5	1.0	2.0