细粒棘球蚴TSP1和TSP6基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 乔军 刘田莉 孟庆玲 才学鹏 胡政香 陈创夫 陈诚 马玉
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 细粒棘球蚴 抗原基因 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 41-46
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 字数: 3798字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.02.008

摘要

为了研究绵羊细粒棘球蚴重要抗原基因 Tetraspanin 1-TSP1（ TSP1）和 Tetraspanin 1-TSP6（ TSP6）的功能，对GenBank中 Eg基因组数据库检索，获得 TSP1和 TSP6的 cDNA序列并设计特异性引物。以 Eg头节为总 RNA 模板，进行 RT-PCR，将 PCR产物克隆到 pMD19-T载体后测序并进行生物信息学分析。TSP1 cDNA 全长792个核苷酸，编码263个氨基酸，该多肽含有3个潜在的 N端糖基化位点，2个 N 端酰基化位点，与已登录的标准株 TSP1基因序列（EG 11043）同源性为98.99%，其推导的氨基酸序列同源性为98.48%；TSP6 cDNA 全长666个核苷酸，编码221个氨基酸，该多肽含有5个 N 端酰基化位点，1个酪氨酸激酶磷酸化位点，与已登录的标准株 TSP6基因序列（ EG 00715）同源性为98.18%，其推导的氨基酸序列同源性为85.07%。运用分子生物学软件对 Eg TSP1和 TSP6基因进行生物信息学分析，预测已知序列的蛋白质抗原的结构和表位，为疫苗的研发奠定了前期基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	才学鹏	中国农业科学院兰州兽医研究所	141	790	15.0	21.0
2	乔军	石河子大学动物科技学院	103	346	8.0	14.0
3	孟庆玲	石河子大学动物科技学院	77	254	7.0	13.0
4	刘田莉	石河子大学动物科技学院	12	42	5.0	5.0
5	陈诚	石河子大学动物科技学院	7	29	4.0	5.0
6	马玉	石河子大学动物科技学院	7	27	4.0	4.0
7	胡政香	石河子大学动物科技学院	9	33	4.0	5.0