霍山石斛托品酮还原酶基因的克隆及其表达分析

• 作者: 叶秀仙 林榕燕 钟淮钦 黄敏玲
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: 霍山石斛 托品酮还原酶 基因克隆 qPCR
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1196-1206
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2017.09.0137

摘要

为了探究托品酮还原酶(tropinone reductase,TR)基因在石斛中的功能,该研究采用RT-PCR结合RACE技术,以霍山石斛原球茎为材料,克隆得到霍山石斛TR-I基因的cDNA序列,其在GenBank中的登录号为KY912085. TR-I基因的cDNA长1 043 bp,包含一个完整的共807 bp的ORF(open reading frame)(79-885),共编码268个氨基酸.生物信息学分析表明,该蛋白质可能是一种疏水性稳定蛋白质,无信号肽,不合卷曲螺旋结构,具有14个功能位点、47个潜在磷酸化位点,其二级结构由螺旋、折叠和卷曲结构组成.系统进化树分析表明,霍山石斛TR-I与铁皮石斛、金钗石斛的亲缘关系较近,处于同一分支.qPCR结果显示,TR-I基因在霍山石斛不同生长期的相对表达量均表现为茎＞叶＞根,且茎和叶中TR-I的表达量均随着生长期的延长呈现低-高-低的变化趋势;在不同品种中,金钗石斛的TR-I基因相对表达量最高,铁皮石斛中最低;不同浓度茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)处理比较,100 μmol/L茉莉酸甲酯处理下TR-I基因表达量最高,推测该基因可能参与霍山石斛生物碱的合成途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄敏玲		41	191	8.0	12.0
2	林榕燕		9	5	1.0	2.0
3	叶秀仙		14	45	5.0	6.0
4	钟淮钦		20	12	3.0	3.0