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摘要:
二穗短柄草基因组已被测序,与麦类作物和牧草近缘.二穗短柄草作为温带禾本科模式植物,有很多重要基因序列结构、进化信息等需要进一步挖掘.以拟南芥AtGLRs氨基酸序列为种子序列,利用Phytozome数据库中Blast工具,获得19个二穗短柄草谷氨酸受体候选序列.基于谷氨酸受体氨基酸序列构建系统发生树,结果显示,BdGLRs与AtGLRs聚类距离较近,亲缘关系较好.将20个AtGLRs和19个BdGLRs分别构建系统发生树,拓扑结构类似,均分为3枝,表明BdGLRs也有3个亚家族.参考AtGLRs的分类和命名规则,将BdGLRs分为3类,分别命名为BdGLR1.1-1.4、BdGLR2.1-2.10和BdGLR3.1-3.5.通过半定量和定量反转录PCR分析发现在三叶期,BdGLR家族各成员表达各异,相同成员在不同组织中表达不同,不同成员在相同组织表达不同.除BdGLR1.4和BdGLR2.6-2.10,其余BdGLRs在根、茎、叶中均有表达.为二穗短柄草的谷氨酸受体基因功能的深入研究提供线索,也为后续禾本科农作物和牧草遗传改良提供理论依据.
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文献信息
篇名 二穗短柄草谷氨酸类受体系统发生学和基因表达分析
来源期刊 华北农学报 学科 生物学
关键词 二穗短柄草 谷氨酸受体 系统发生树 半定量反转录PCR
年,卷(期) 2017,(6) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 99-105
页数 7页 分类号 Q943.2
字数 4854字 语种 中文
DOI 10.7668/hbnxb.2017.06.015
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘洋 9 11 2.0 2.0
2 祁智 内蒙古大学生命科学学院 17 26 3.0 3.0
3 亢燕 内蒙古大学生命科学学院 6 15 3.0 3.0
4 安丹丹 内蒙古大学生命科学学院 1 1 1.0 1.0
5 程宇来 2 3 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
二穗短柄草
谷氨酸受体
系统发生树
半定量反转录PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
华北农学报
双月刊
1000-7091
13-1101/S
大16开
石家庄市和平西路598号
18-10
1986
chi
出版文献量(篇)
6276
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4
总被引数(次)
88357
论文1v1指导