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二穗短柄草谷氨酸类受体系统发生学和基因表达分析
二穗短柄草谷氨酸类受体系统发生学和基因表达分析
作者:
亢燕
刘洋
安丹丹
祁智
程宇来
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
二穗短柄草
谷氨酸受体
系统发生树
半定量反转录PCR
摘要:
二穗短柄草基因组已被测序,与麦类作物和牧草近缘.二穗短柄草作为温带禾本科模式植物,有很多重要基因序列结构、进化信息等需要进一步挖掘.以拟南芥AtGLRs氨基酸序列为种子序列,利用Phytozome数据库中Blast工具,获得19个二穗短柄草谷氨酸受体候选序列.基于谷氨酸受体氨基酸序列构建系统发生树,结果显示,BdGLRs与AtGLRs聚类距离较近,亲缘关系较好.将20个AtGLRs和19个BdGLRs分别构建系统发生树,拓扑结构类似,均分为3枝,表明BdGLRs也有3个亚家族.参考AtGLRs的分类和命名规则,将BdGLRs分为3类,分别命名为BdGLR1.1-1.4、BdGLR2.1-2.10和BdGLR3.1-3.5.通过半定量和定量反转录PCR分析发现在三叶期,BdGLR家族各成员表达各异,相同成员在不同组织中表达不同,不同成员在相同组织表达不同.除BdGLR1.4和BdGLR2.6-2.10,其余BdGLRs在根、茎、叶中均有表达.为二穗短柄草的谷氨酸受体基因功能的深入研究提供线索,也为后续禾本科农作物和牧草遗传改良提供理论依据.
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文献信息
篇名
二穗短柄草谷氨酸类受体系统发生学和基因表达分析
来源期刊
华北农学报
学科
生物学
关键词
二穗短柄草
谷氨酸受体
系统发生树
半定量反转录PCR
年,卷(期)
2017,(6)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
99-105
页数
7页
分类号
Q943.2
字数
4854字
语种
中文
DOI
10.7668/hbnxb.2017.06.015
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
刘洋
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祁智
内蒙古大学生命科学学院
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亢燕
内蒙古大学生命科学学院
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安丹丹
内蒙古大学生命科学学院
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程宇来
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节点文献
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谷氨酸受体
系统发生树
半定量反转录PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
华北农学报
主办单位:
河北
北京
天津
山西
河南
内蒙古六省市农科院农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7091
CN:
13-1101/S
开本:
大16开
出版地:
石家庄市和平西路598号
邮发代号:
18-10
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
总被引数(次)
88357
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