中国甘薯双生病毒C4基因分子变异及遗传多态性分析

• 作者: 孙厚俊 张成玲 徐振 杨冬静 谢逸萍 赵永强
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘薯双生病毒 C4基因 分子变异 遗传多态性
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·生理生化
• 页码范围: 487-492
• 页数: 6页
• 分类号: S435.311
• 字数: 3971字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2017.03.002

摘要

甘薯双生病毒是中国甘薯上一种重要的病毒,其C4基因编码的蛋白是一个多功能蛋白,参与了寄主症状的形成及病毒在植物体内移动等.本研究利用PCR方法扩增了24个分离物的C4基因,通过SDT、DnaSP等软件分析,结果表明,24个分离物核苷酸序列均为258个碱基,一致率为73.3%~100.0%,编码85个氨基酸,一致率为47.1%~100.0%.中国甘薯双生病毒分离物C4基因构建系统进化树分为2个组,组Ⅰ包括本研究的15个双生病毒分离物及中国大部分双生病毒分离物,又分为2个亚组,亚组2仅有15个双生病毒分离物,其中本研究的6个分离物位于此亚组;组Ⅱ含有30个双生病毒分离物,包括本研究的9个分离物.非同义突变与同义突变比值大于1,说明C4基因处于正向选择.亚组1错配分布图为单峰,说明该组种群呈突然暴发的状态,其余组或亚组为多峰锯齿状,表明种群或者亚种群已经存在很长时间,长期处于动态平衡.