生物信息学分析CysC特异性肽段及质谱验证

• 作者: 季伙燕 沈培 沈蕾 王建新 王惠民
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 半胱氨酸蛋白酶抑制剂C 生物信息学技术 特异性肽段 质谱
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 临床实验研究
• 页码范围: 444-447
• 页数: 4页
• 分类号: R446.1
• 字数: 3531字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2017.06.13

摘要

目的 用生物信息学技术分析半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(CysC)的特异性肽段及其性质,并用质谱技术验证预测结果.方法 用在线软件工具分析胰蛋白酶水解CysC产生的肽段和同源性,预测特异性肽段质谱扫描离子化碎片信息;对人工合成的特异性多肽样品进行母离子扫描和子离子扫描,人重组CysC和血清样品经胰蛋白酶水解后分析质谱,比较分析结果与预测结果.结果 选择T3 (ALDFAVGEYNK)肽段作为CysC的特异性肽段,用串联质谱对T3样品[M +2H]2+进行子离子扫描,几乎可发现Skyline软件预测的所有b离子和y离子.人重组CysC和血清样品经胰蛋白酶水解出的肽段与T3*在同一时间出峰.结论 用生物信息学技术快速准确地筛选出了CysC特异性肽段并准确预测该肽段质谱扫描离子化碎片.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王惠民	南通大学附属医院检验科	188	712	11.0	17.0
2	王建新	南通大学附属医院检验科	69	162	7.0	9.0
3	季伙燕	南通大学附属医院检验科	31	71	6.0	6.0
4	沈蕾	南通大学附属医院检验科	15	15	2.0	3.0
5	沈培	南通大学附属医院检验科	2	3	1.0	1.0