miR-1246和miR-1261在模拟失重48 h后人肺微血管内皮细胞中的表达及生物信息学分析

• 作者: 孙喜庆 张丽君 徐沁 李程飞 王永春 石菲 褚孟洋 赵疆东 闫铭 高原
• 来源期刊: 贵州医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肺 模拟失重 血管内皮细胞 miR-1246 miR-1261 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 专题研究2
• 页码范围: 639-645
• 页数: 7页
• 分类号: R852.22
• 字数: 4015字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19367/j.cnki.1000-2707.2017.06.006

摘要

目的:检测模拟失重48 h人肺微血管内皮细胞(HMVEC-L) miR-1246和miR-1261表达的改变,利用生物信息学方法分析预测其靶基因.方法:以回转器行模拟失重效应48 h的HMVEC-L为模拟失重组,同时设正常重力对照组,比较两组细胞miRNA表达谱的变化,应用Real-time PCR检测HMVEC-L细胞miR-1246和miR-1261的表达,通过TargetScan、miRDB和miRanda对miR-1246和miR-1261的靶基因进行预测以及功能注释和通路富集分析.结果:与正常重力对照组比较,模拟失重48 h可引起HMVEC-L细胞中29种miRNA呈现显著差异性表达,miR-1246和miR-1261显著降低,差异有统计学意义(P＜0.05);生物信息学分析显示miR-1246和miR-1261的靶基因涉及生物过程、分子功能及细胞组成等多种功能,主要参与了磷酸化通路、凋亡相关通路和细胞骨架等相关分子的调控.结论:模拟失重48 h后可引起HMVEC-L细胞miR-1246和miR-1261的表达降低,提示其可能参与了模拟失重后内皮细胞功能异常的调控.