嗜吞噬细胞无形体ZJ-msp4基因的生物信息学分析

• 作者: 冉光鑫 杨斌 杨霞 王永树 盛金良 赵庆亮
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 生物学
• 关键词: 嗜吞噬细胞无形体 生物信息学 ZJ-msp4 信号肽 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 32-35,287-288
• 页数: 1页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文

摘要

为了利用生物信息学预测嗜吞噬细胞无形体ZJ-msp4蛋白的优势抗原表位,给寻找无形体病诊断和预防的候选抗原表位提供参考,试验参照GenBank中的msp4基因序列(登录号为EU008082.1)进行生物信息学分析.结果表明:ZJ-msp4蛋白的分子质量为30.1 ku,理论等电点为5.71,该蛋白的不稳定系数为29.13,组成较多的氨基酸有丝氨酸(Ser,13.8％)、甘氨酸(Gly,9.2％)、丙氨酸(Ala,8.9％)等;二级结构预测ZJ-msp4蛋白主要以无规卷曲、延伸链、0螺旋为主,TMHMM2.0预测该蛋白的第7～ 29位氨基酸可能为跨膜区,该跨膜区可能为信号肽序列;SignalP 4.1预测在msp4蛋白的N端第1～29位氨基酸序列为信号肽序列,该分析结果与TMHMM2.0分析结果一致;B细胞表位预测该msp4蛋白有11个线性表位,其中以28～38位、64 ～ 77位、87～101位、134～143位、245 ～264位是ZJ-msp4蛋白的优势抗原表位区段,可以作为诊断无形体病的候选表位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨斌		9	1	1.0	1.0
2	赵庆亮		12	1	1.0	1.0
3	王永树		4	4	1.0	2.0
4	冉光鑫		5	0	0.0	0.0
5	杨霞		1	0	0.0	0.0
6	盛金良		1	0	0.0	0.0