虚拟筛选竞争性抑制NDRG3与L-Lactate结合的小分子研究

• 作者: 吴艳华 周兴智 曹洪玉 蒋革 郑学仿
• 来源期刊: 华南师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 化学
• 关键词: NDRG3 L-Lactate 竞争性抑制剂 同源模建 分子对接 虚拟筛选
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 生物学与生物工程
• 页码范围: 58-64
• 页数: 7页
• 分类号: O641.3
• 字数: 4357字
• 语种: 中文

摘要

竞争性抑制NDRG3(N-myc Downstream Regulated Gene 3)蛋白与L-Lactate结合可有效阻遏NDRG3介导的低氧反应.文中通过同源模建技术构建NDRG3蛋白的三维结构,并将L-Lactate对接到NDRG3蛋白的潜在活性位点中,发现L-Lactate主要通过与Asn133、Ala162、His163、His164、Ser235、Pro236及Ala237等氨基酸相互作用结合于NDRG3.对近3000个化合物进行虚拟筛选,选择4种竞争性抑制最强的化合物作为参考分子分析相互作用关系.结果发现:部分化合物和不同氨基酸能够通过不同的作用力与NDRG3蛋白结合,占据NDRG3蛋白的活性位点,从而竞争性抑制L-Lactate与NDRG3蛋白结合.例如,它们能够与Lys139、Asp143、His163、Arg203产生静电作用;它们与His163形成π-π堆积作用;它们与Phe165、Ala237等产生疏水作用;它们与Asn133、Asp135、Gly140、Arg203、Ser235、Ala237等形成氢键作用.以上数据表明:这些化合物可能成为阻遏NDRG3介导的低氧反应及靶向治疗低氧诱导疾病的候选药物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑学仿	大连大学生命科学与技术学院	87	492	10.0	17.0
2	曹洪玉	大连大学生命科学与技术学院	59	197	6.0	10.0
3	蒋革	大连大学生命科学与技术学院	32	160	5.0	12.0
4	吴艳华	大连大学生命科学与技术学院	5	11	3.0	3.0
5	周兴智	大连大学生命科学与技术学院	4	7	2.0	2.0