莱茵衣藻APC/C复合物基因家族及CrCDC20表达谱分析

• 作者: 王潮岗 罗秋兰 胡章立
• 来源期刊: 深圳大学学报（理工版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 微藻分子生物学 生物柴油 细胞周期 E3泛素连接酶 进化树分析 实时荧光定量反转录聚合酶链式反应
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 172-178
• 页数: 7页
• 分类号: Q946.1
• 字数: 5205字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1249.2018.02172

摘要

为揭示莱茵衣藻细胞周期调控机制,提高微藻生物量,通过生物信息学方法,对莱茵衣藻参与细胞周期控制的末期促进复合物 (anaphase-promoting complex/cyclosome, APC/C) 基因家族的性质进行系统分析,包括基因结构、蛋白质特性和进化树分析等.结果显示,莱茵衣藻包含13个APC/C复合物编码基因,在13号染色体存在一个基因簇.除了激活因子细胞分裂周期蛋白20 (cell division cycle 20, CDC20) 和CDC20同系蛋白1 (CDC20 homolog 1, CDH1) 相对保守外,莱茵衣藻APC/C复合物的其他亚基与高等植物来源的蛋白质保守性很低.此外,利用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应 (real-time fluorescence quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,rt-RT-qPCR) 分析了莱茵衣藻CrCDC20基因在缺氮或缺硫下表达谱,发现CrCDC20基因在缺硫下上调表达,在缺氮下下调表达,说明CrCDC20参与莱茵衣藻的营养缺乏胁迫应答反应.