侵染蚕豆ClYVV的鉴定及其衍生的小干扰RNA的深度测序鉴定研究

• 作者: 严丹侃 张趁华 彭杰军 林林 燕飞 章东方 郑红英 陈剑平 韩科雷 鲁宇文
• 来源期刊: 浙江农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蚕豆 ClYVV 小干扰RNA
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 406-412
• 页数: 7页
• 分类号: Q945.8
• 字数: 3746字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2018.03.08

摘要

对安徽省合肥市采集到的具有明显典型花叶症状的蚕豆叶片进行深度测序,鉴定到样品中存在三叶草黄脉病毒(Clover yellow vein virus,ClYVV),并获得了ClYVV的完整基因组序列,随后通过直接测序扩增基因组区域获得完整的基因组ClYVV-HF.获得的ClYVV-HF基因组由9585个核苷酸组成,不包括poly(A)尾巴.ClYVV-HF的全部核苷酸序列与之前报道的来自日本的分离株(AB011819、NC 003536)和来自韩国的分离株(KF975894)分别具有95.45%和95.10%的核苷酸同源性.进一步分析了ClYVV-HF衍生的小干扰RNA的表征.vsiRNAs的大小为21~22 nt,vsiRNAs的5′末端碱基偏向于A / U.ClYVV-HF来源的小干扰RNA大多来源于其基因组链中的7个热点,其中5个热点以21 nt vsiRNAs为主.生物学实验表明,ClYVV可通过汁液摩擦接种多种豆科作物.这是有关中国ClYVV分离株全部核苷酸序列的首次报道.