小兰屿蝴蝶兰R2R3-MYB转录因子分析

• 作者: 李潞滨 梁立雄 王涛 王雪霁
• 来源期刊: 林业科学研究
• 关键词: 小兰屿蝴蝶兰 R2R3-MYB转录因子家族 全基因组分析
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 104-113
• 页数: 10页
• 分类号: S682.31
• 语种: 中文
• DOI: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.03.014

摘要

[目的]本研究为了探讨在植物发育和抗逆过程扮演着重要角色的MYB转录因子的潜在功能.[方法]利用拟南芥MYB转录因子家族蛋白序列(AtMYBs)和已报道的蝴蝶兰R2R3-MYB转录因子家族蛋白序列(PeMYBs),采用本地化软件BLASTP对小兰屿蝴蝶兰全基因组数据库进行搜索,并利用Pfam数据库验证MYB结构域,获得小兰屿蝴蝶兰MYB转录因子家族编码序列(PeMYBs)125条,包含1R-MYB结构域的PeMYBs蛋白序列27条,R2R3-MYB结构域96条,R1R2R3-MYB结构域2条.重点对96条R2R3-MYB结构PeMYBs蛋白序列特点进行生物信息学分析.[结果]依据拟南芥的分类标准将小兰屿蝴蝶兰R2 R3-MY B类转录因子划分为20个亚群,预测获得同源性较高的直系和旁系同源基因;各基因在四种器官(花、叶、根、茎)中的表达情况各异,39个PeMYBs基因在4种器官中均表达,48个基因在不同器官中有特异性不表达现象,一些基因呈现器官特异性表达特点,推测其可能参与相应组织特定发育时期的调控.[结论]预测获得125条PeMYBs蛋白序列,并对部分PeMYB转录因子可能的调控功能进行了预测,将为细致研究蝴蝶兰MYB转录因子调控植物生长发育和逆境胁迫响应的分子机理提供一定的数据基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王雪霁		1	1	1.0	1.0
2	梁立雄		2	2	1.0	1.0
3	李潞滨		2	2	1.0	1.0
4	王涛		2	2	1.0	1.0