葡萄基因组无内含子基因生物信息学及其表达分析

• 作者: 上官凌飞 刘众杰 崔梦杰 房经贵 李傲 贾海峰 陈立德
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 无内含子基因 生物信息学 亚细胞定位预测 功能预测 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 植物科学
• 页码范围: 655-661
• 页数: 7页
• 分类号: S663.1
• 字数: 4901字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201707034

摘要

[目的]本文旨在研究葡萄(Vitis vinifera)无内含子基因的结构特征、功能以及表达特点.[方法]对葡萄19条染色体上4 906个(占整个基因组的13.8％)无内含子基因情况进行分析,并研究了无内含子基因的亚细胞结构、GO功能类型以及基因在不同组织的表达情况.[结果]葡萄无内含子基因数与每条染色体长度和染色体的基因总数存在正相关关系,每条染色体上无内含子基因占染色体上基因总数的1.2％～ 1.5％,同时无内含子基因在同一条染色体上的分布是不均匀的,更偏向富集于染色体的两端.葡萄无内含子基因的平均长度为997 bp,比总基因的平均长度短,是总基因长度的1/5.葡萄无内含子基因的亚细胞定位表明,基因产物分布在叶绿体上的数最多,线粒体上几乎没有.基因功能预测结果表明,葡萄无内含子基因主要为生长因子、转录调控、电压门控离子通道以及结构蛋白4种,其中更多参与生长调节.葡萄无内含子基因在不同组织中的表达水平低于有内含子的基因.[结论]葡萄无内含子基因与有内含子基因相比长度较短,表达水平较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	上官凌飞	南京农业大学园艺学院	37	426	13.0	20.0
2	房经贵	南京农业大学园艺学院	194	3087	29.0	47.0
3	李傲	南京农业大学园艺学院	6	11	2.0	3.0
4	刘众杰	南京农业大学园艺学院	12	49	5.0	6.0
5	崔梦杰	南京农业大学园艺学院	10	7	2.0	2.0
6	陈立德	南京农业大学园艺学院	4	3	1.0	1.0
7	贾海峰	南京农业大学园艺学院	2	3	1.0	1.0