杂色鲍幼虫变态及TR干扰下内参基因的筛选

• 作者: 张丽莉 徐建波 王国栋 王艺磊
• 来源期刊: 集美大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 杂色鲍 内参基因 稳定性 变态 TRRNAi
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 水产、食品与生物技术
• 页码范围: 91-98
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 字数: 5894字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7405.2018.02.003

摘要

内参基因的稳定性对实时定量PCR的结果影响巨大.采用GeNorm、normFinder和RefFinder三款软件比较了鲍变态和干扰幼虫甲状腺激素受体(TR)两种情况下内参基因的稳定性.软件分析了EIF5A、OAZ1、YB1、RPL3、RPS9和ACT等6个候选内参基因的Ct值,据此获得各基因的稳定值.在杂色鲍幼虫的变态过程中,EIF5A稳定性最高,排名平均数为1,表明该基因可以作为这一阶段实时定量PCR的内参基因,但是在干扰TR情况下,EIF5A的稳定性下降,排名平均数为3.91.RPS9则与之相反,在变态过程该基因表达稳定性最差,而在干扰TR时表达稳定性最好.ACT在两种情况下稳定性较好,排名平均数均位列第二位,可以作为这两种情况下的通用内参基因.其他基因的稳定性在这两种情况下也发生剧烈变换.这表明内参基因的稳定与样品具体处理情况关系密切.为了保证定量PCR结果的准确性,需要针对具体处理情况相应地进行内参基因的稳定性评估.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王艺磊	集美大学水产学院	80	1300	17.0	35.0
3	张丽莉	集美大学水产学院	19	41	3.0	5.0
7	王国栋	集美大学水产学院	27	69	5.0	7.0
13	徐建波	集美大学水产学院	2	6	2.0	2.0