益母草叶绿体基因组序列与系统进化位置分析

• 作者: 何帅兵 刘昶 唐泰山 孔繁德 张慧 徐淑菲 苗丽 陈海梅
• 来源期刊: 中医药信息
• 学科: 医学
• 关键词: 益母草 叶绿体基因组 重复序列 系统进化
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 中药研究
• 页码范围: 21-27
• 页数: 7页
• 分类号: R285.5
• 字数: 3717字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19656/j.cnki.1002-2406.180108

摘要

目的:对益母草叶绿体基因组序列与系统进化位置进行分析,旨在为益母草种质资源的开发和利用提供科学依据.方法:采用二代测序技术对益母草全基因组DNA进行测序,并成功组装了其完整的叶绿体基因组.结果:益母草叶绿体基因组全长159 375 bp,由一个大的单拷贝区(LSC) 87 204 bp,一个小的单拷贝区(SSC)17 515 bp和一对27 099 bp的反向重复序列(IRs)组成.基因组注释结果显示其共编码115个基因,包括99个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因.叶绿体基因组GC含量为38.41％.同时,本研究共检测到160个简单重复序列和49个串联重复序列.结论:系统发育分析表明,益母草属与水苏属的亲缘关系较近,本研究为益母草药材精准鉴定与遗传多样性研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐淑菲	厦门出入境检验检疫局技术中心	60	557	13.0	20.0
2	孔繁德	厦门出入境检验检疫局技术中心	99	925	16.0	26.0
3	唐泰山		41	282	9.0	15.0
4	苗丽		39	170	7.0	12.0
5	张慧	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	6	6	2.0	2.0
6	刘昶		2	1	1.0	1.0
7	何帅兵	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	1	1	1.0	1.0
8	陈海梅	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	1	1	1.0	1.0