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摘要:
以甘肃鼢鼠(Myospalax cansus)脂肪组织作为研究对象,采用PCR技术克隆鼢鼠ATGL基因,运用生物信息学方法分析序列特征、系统进化关系以及预测ATGL的理化性质与分子结构,利用qRT-PCR技术检测鼢鼠ATGL基因mRNA表达水平.结果表明,鼢鼠ATGL基因CDS序列全长1 461 bp(GenBank登录号:KY030728),编码486个氨基酸.序列比对结果显示,鼢鼠ATGL基因序列与小鼹形鼠(Nannospalax galili)、中国仓鼠(Cricetullus griseus)、小鼠(Mus musculus)、大鼠(Rattus norvegicus)、人(Homo sapiens)、猪(Sus scrofa)、牛(Bos taurus)等物种相比均具有较高的相似性(81%以上).多物种ATGL氨基酸序列的系统进化分析表明,鼢鼠ATGL与中国仓鼠、小鼠和大鼠的亲缘关系较近.ATGL分子结构预测发现,其N端含有1个Patatin结构域和具有酯酶活性的GASAG结构.组织表达分析结果显示,ATGL基因在被检测的8个组织中均有表达,表达量由高到低依次为棕色脂肪组织、皮下脂肪组织、肝脏、内脏脂肪组织、心脏、脾、肌肉和肾,且棕脂中A TGL的表达量显著高于其他组织(P<0.05).研究获得了鼢鼠A TGL基因CDS全长及组织表达规律,表明棕脂对于鼢鼠野外生存具有重要意义,为进一步阐明鼢鼠适应地下生活的能量代谢方式提供理论依据.
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文献信息
篇名 甘肃鼢鼠甘油三酯脂酶基因(ATGL)CDS克隆及组织表达分析
来源期刊 西北林学院学报 学科
关键词 甘肃鼢鼠 甘油三酯脂酶基因(ATGL) 克隆 生物信息学分析 组织表达
年,卷(期) 2018,(2) 所属期刊栏目 森林保护学
研究方向 页码范围 139-145
页数 7页 分类号 S718.6
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-7461.2018.02.23
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 卜书海 西北农林科技大学生命科学学院 41 454 12.0 19.0
2 韩崇选 西北农林科技大学林学院 97 1043 18.0 25.0
3 郑雪莉 西北农林科技大学林学院 27 138 7.0 10.0
4 李琦 西北农林科技大学林学院 9 167 5.0 9.0
5 范佳敏 西北农林科技大学生命科学学院 1 1 1.0 1.0
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甘肃鼢鼠
甘油三酯脂酶基因(ATGL)
克隆
生物信息学分析
组织表达
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西北林学院学报
双月刊
1001-7461
61-1202/S
大16开
1984-01-01
chi
出版文献量(篇)
5683
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总被引数(次)
73559
论文1v1指导