谷子超氧化物歧化酶基因家族生物信息学分析

• 作者: 刘颖慧 宋亚菲 张佳阔 瓮巧云 生云龙 袁进成 赵治海 赵艳
• 来源期刊: 中国农业科技导报
• 学科: 生物学
• 关键词: 谷子 超氧化物歧化酶 生物信息分析
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术 生命科学
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.13304/j.nykjdb.2017.0493

摘要

超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)是重要的抗氧化酶,在生物体内广泛存在.以谷子基因数据库为搜索平台,利用生物信息学方法对谷子超氧化物歧化酶基因家族进行全基因组扫描和生物信息学分析.结果表明:谷子SOD基因家族包含8个基因,不均匀的分布在6条染色体上,8个基因的外显子数量为1～9个,蛋白质的氨基酸序列长度在56～ 334 aa之间.谷子中的8个SOD蛋白,有5个具有Cu-SOD基序,3个具有Mn-SOD基序.进化树分析表明,谷子SOD蛋白与水稻、高梁SOD蛋白序列具有较高的同源性.该研究结果可以为进一步了解谷子SOD基因家族和谷子抗氧化机制提供一定参考.