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甘蓝型油菜BnTCP7基因的克隆和表达分析
甘蓝型油菜BnTCP7基因的克隆和表达分析
作者:
刘双双
岳出
王茂林
蒋学飞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甘蓝型油菜
TCP7转录因子
非生物胁迫
ABA
GA3
摘要:
该研究克隆获得了甘蓝型油菜预测转录因子TCP7-like同源编码基因,命名为BnTCP7,与甘蓝型油菜TCP7 like NC_027757基因的核苷酸序列相似性为95.68%.Bn TCP7基因开放阅读框全长为648 bp,编码215个氨基酸.BnTCP7氨基酸序列与十字花科(Brassicaceae)中其他19条TCP7或者TCP7 like氨基酸序列比对发现,BnTCP7与芸薹属和萝卜属等TCP7同源蛋白具有很强的相似性和保守性,尤其在靠近N端的TCP保守结构域,具有典型的螺旋-环-螺旋结构,且BnTCP7属于TCP家族Ⅰ类,为亲水性不稳定蛋白.通过BnTCP7和拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtTCP7 (NC_003076)蛋白的二级和三级结构在线预测比对分析,进一步证实BnTCP7具有TCP家族典型结构.进化树分析表明,BnTCP7蛋白与甘蓝型油菜TCP7-like NC_027757蛋白聚在同一分支,两者亲缘关系最近.利用转录组数据对不同时期不同器官BnTCP7基因表达模式分析发现,其表达量呈现一定差异性,其中营养器官中的表达量高于生殖器官.非生物胁迫及激素处理对甘蓝型油菜幼苗植株中BnTCP7基因的表达影响分析发现,Bn TCP7基因不仅响应了冷、热、损伤等非生物胁迫,而且参与了ABA和GA3激素的信号转导,表明BnTCP7基因在植物维持正常生长发育和逆境胁迫中可能发挥重要作用.
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自交不亲和
SLG基因
同源性分析
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甘蓝型油菜
CBF
低温
冻害
基因表达分析
内容分析
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相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
甘蓝型油菜BnTCP7基因的克隆和表达分析
来源期刊
西北植物学报
学科
生物学
关键词
甘蓝型油菜
TCP7转录因子
非生物胁迫
ABA
GA3
年,卷(期)
2018,(7)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1187-1193
页数
7页
分类号
Q785|Q786
字数
5306字
语种
中文
DOI
10.7606/j.issn.1000-4025.2018.07.1187
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王茂林
四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室
80
590
14.0
21.0
2
刘双双
四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室
12
41
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6.0
3
蒋学飞
四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室
4
5
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4
岳出
四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室
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共引文献
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同被引文献
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引证文献(0)
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研究主题发展历程
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TCP7转录因子
非生物胁迫
ABA
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西北植物学报
主办单位:
西北农林科技大学
陕西省植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-4025
CN:
61-1091/Q
开本:
大16开
出版地:
陕西省杨陵邰城路3号西北农林科技大学
邮发代号:
52-73
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
7739
总下载数(次)
9
总被引数(次)
145271
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西北植物学报2018年第4期
西北植物学报2018年第3期
西北植物学报2018年第2期
西北植物学报2018年第12期
西北植物学报2018年第11期
西北植物学报2018年第10期
西北植物学报2018年第1期
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