苹果砧木‘SH6’中RGLs基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘静 卜芋芬 卢艳芬 姚允聪 郝素晓 陈琦 麻楠
• 来源期刊: 北京农学院学报
• 学科: 农学
• 关键词: SH6 DELLA蛋白 RGL1b RGL2a RGL2b 株高
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S661.1
• 字数: 4184字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2018.0201

摘要

[目的]从苹果砧木‘SH6’中分离出三个DELLA家族基因RGL1b,RGL 2a,RGL 2b,为探究苹果DELLA蛋白家族对植株生长发育的调控机理,对这三个基因进行了生物信息学分析.[方法]通过克隆技术从苹果砧木‘SH6’中分离得到RGL1b,RGL 2a,RGL 2b的编码序列,利用生物学工具分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR方法分析其基因表达水平.[结果]序列分析表明,苹果砧木‘SH6’的3种RGLs序列具有较高相似性,均存在DELLA蛋白和GRAS家族的结构特征.但序列也存在部分差异,预测其编码的蛋白都具有亲水性能,RGL1b,RGL2a蛋白大部分定位在细胞质,而RGL2b主要分布在细胞核.用实时荧光定量PCR方法,检测了‘SH6’及其亲本‘国光’中这3种RGLs基因的相对表达水平,结果显示,RGL 1b,RGL 2a,RGL 2b在‘SH6’中的表达量均明显高于‘国光’中的表达.[结论]苹果砧木‘SH6’中RGL1b,RGL2a,RGL 2b基因可能在果树矮化中发挥重要作用.