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摘要:
为了解船舶压载水沉积物中微生物多样性,利用Illumina MiSeq 2500高通量测序平台对上海港到港船舶压载水沉积物中细菌基因样本进行测序,并进行生物信息分析.从1 1份压载水沉积物样品中共检测到420 069条有效序列,微生物群落分析结果显示共有38门、98纲、226目、393科、704属细菌,优势类群为变形菌门(Proteobacteria 72.98%)、放线菌门(Actinobacteria 9.11%)、拟杆菌门(Bacteroidetes 8.71%)、绿弯菌门(Chloroflexi 4.06%)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes 1.47%)、酸杆菌门(Acidobacteria 1.18%)和其他(2.50%).本次研究在压载水沉积物中检测到了分枝杆菌属(Mycobacterium)、游动球菌属(Planococcus)、假单胞菌属(Paenibacillus)、类芽孢杆菌属(Streptomyces)和链霉菌属(Inquilinus)的致病菌或条件致病菌.结果显示压载水沉积物中微生物多样性丰富,要充分重视我国到港船舶压载水沉积物中微生物以及致病菌的研究,为阐明外来致病菌通过压载水途径入侵的机制和防控奠定基础.
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内容分析
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文献信息
篇名 上海港到港船舶压载水沉积物细菌群落多样性
来源期刊 上海海洋大学学报 学科 农学
关键词 上海港 压载水沉积物 细菌 多样性
年,卷(期) 2018,(3) 所属期刊栏目 压载水生态学
研究方向 页码范围 344-349
页数 6页 分类号 Q939.1|S917
字数 语种 中文
DOI 10.12024/jsou.20171210007
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王琼 上海海洋大学海洋生态与环境学院 18 58 5.0 6.0
5 吴惠仙 上海海洋大学海洋生态与环境学院 65 365 10.0 14.0
9 边佳胤 3 7 2.0 2.0
10 肖南燕 上海海洋大学海洋生态与环境学院 2 12 2.0 2.0
14 王飞飞 上海海洋大学海洋生态与环境学院 1 2 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
上海港
压载水沉积物
细菌
多样性
研究起点
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
上海海洋大学学报
双月刊
1004-7271
31-2024/S
大16开
上海市军工路334号
4-604
1992
chi
出版文献量(篇)
2427
总下载数(次)
5
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