野生蕉miR395a前体克隆与进化特性及启动子分析

• 作者: 倪珊珊 刘彦英 刘炜婳 李汉生 林争春 林玉玲 赖钟雄
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 野生蕉 pre-miR395a 克隆 进化特性 启动子分析 qPCR
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 89-96
• 页数: 8页
• 分类号: S668.101|Q78
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2017.09042

摘要

植物miR395参与硫代谢调控,并在应答逆境胁迫等方面起重要调控作用.为了解香蕉miR395的分子特性和进化规律,在参考香蕉基因组信息的基础上,结合RT-PCR技术,从三明野生蕉(Musa itinerans)叶片中获得81 nt miR395a前体序列,包含21 nt miR395a成熟体序列.进化特性分析表明,植物miR395a前体存在于27个物种中,野生蕉pre-miR395a序列与双子叶耧斗菜(Aquilegia viridiflora Pall.)最为接近,与单子叶的水稻、玉米、高梁最远,表明野生蕉pre-miR395a的起源比较特殊;前体序列长度差异较大(57-226 nt);miR395a成熟体序列分析发现,来自5p臂上的miR395a序列特异性较大.野生蕉miR395a前体能形成典型的发卡结构,miR395a成熟体位于前体的3p臂上.转录起始位点分析表明,野生蕉pri-miR395a转录起始区域位于-87 bp--38 bp,A为转录起始位点.启动子顺式作用元件预测分析表明,野生蕉miR395a启动子包含多个激素、胁迫、生物钟及光响应元件,可能与响应胁迫密切相关.qPCR检测结果也发现miR395a的表达量在低温胁迫下极显著下调,表明响应低温胁迫.综上表明三明野生蕉在响应低温胁迫过程中miR395a起着重要调控作用,这对于进一步研究野生蕉miR395a在低温胁迫中的作用机制具有参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄		473	4127	31.0	41.0
2	林争春		14	84	4.0	9.0
3	林玉玲		148	560	10.0	16.0
4	刘炜婳		10	23	3.0	4.0
5	李汉生		12	54	3.0	7.0
6	刘彦英		4	0	0.0	0.0
7	倪珊珊		7	3	1.0	1.0