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干旱处理下2个梨品种转录组差异表达基因分析
干旱处理下2个梨品种转录组差异表达基因分析
作者:
刘春旖
徐小牛
朱立武
汪王微
王华
王巧巧
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
梨
干旱
转录组
差异表达基因
代谢通路
转录因子
摘要:
[目的]以转录组数据为基础挖掘梨抗旱关键基因,为培育梨抗旱品种提供理论基础.[方法]以正常浇水和干旱处理下黄冠梨Pyrus bretschneideri ‘Xuehuali’×P.pyrifolia ‘Shinsseiki’和黄金梨P.pyrifolia‘Niitaka’×P.pyrifolia‘Nijisseiki’的叶片进行Illumina Hi SeqTM2000高通量转录组测序分析,利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库分析2个梨品种中的差异表达基因(DEGs).[结果]2个梨品种间在正常浇水和干旱处理下分别发现了4 377和3 841个DEGs,其中只在干旱处理下的DEGs有1 340个.这些DEGs在GO数据库的3个本体生物过程、分子功能和细胞成分中富集到的数量分别是1 387、922和1 253个,与植物抗旱相关的代谢过程、应激反应和生物膜等条目分别富集到349、139和151个DEGs.仅在干旱处理下的1 340个DEGs被比对到102个KEGG代谢通路上,其中与植物内源激素相关的代谢通路有3个.将1 340个DEGs进行转录因子分析发现,被注释为转录因子的有37个,分布在17个转录因子家族中,其中乙烯应答转录因子(ERF)家族所拥有的DEGs最多,为11个.[结论]本研究发现了与梨抗旱相关的内源激素代谢基因和转录因子,干旱胁迫下这些基因在2个梨品种中差异表达,这可能与2个品种的抗旱性差异存在密切关系,为下一步梨抗旱分子机理研究奠定了基础.
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割手密
干旱
转录组
差异表达基因
干旱胁迫下花生差异表达转录因子家族分析
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干旱胁迫
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文献信息
篇名
干旱处理下2个梨品种转录组差异表达基因分析
来源期刊
华南农业大学学报
学科
农学
关键词
梨
干旱
转录组
差异表达基因
代谢通路
转录因子
年,卷(期)
2018,(4)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
61-67
页数
7页
分类号
S661.2
字数
4268字
语种
中文
DOI
10.7671/j.issn.1001-411X.2018.04.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
徐小牛
安徽农业大学林学与园林学院
107
1235
18.0
30.0
2
朱立武
安徽农业大学果树学重点实验室
110
1099
19.0
27.0
3
王华
安徽农业大学果树学重点实验室
23
101
6.0
9.0
4
汪王微
安徽农业大学果树学重点实验室
3
5
1.0
2.0
5
王巧巧
安徽农业大学果树学重点实验室
2
2
1.0
1.0
6
刘春旖
安徽农业大学果树学重点实验室
1
1
1.0
1.0
传播情况
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共引文献
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节点文献
引证文献
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同被引文献
(9)
二级引证文献
(0)
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
1988(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1991(1)
参考文献(1)
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1994(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1995(3)
参考文献(1)
二级参考文献(2)
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参考文献(0)
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参考文献(0)
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参考文献(0)
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参考文献(2)
二级参考文献(6)
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2019(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
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节点文献
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干旱
转录组
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代谢通路
转录因子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
华南农业大学学报
主办单位:
华南农业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-411X
CN:
44-1110/S
开本:
大16开
出版地:
广州五山华南农业大学学报编辑部
邮发代号:
创刊时间:
1959
语种:
chi
出版文献量(篇)
2705
总下载数(次)
5
总被引数(次)
47288
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