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摘要:
[目的]以转录组数据为基础挖掘梨抗旱关键基因,为培育梨抗旱品种提供理论基础.[方法]以正常浇水和干旱处理下黄冠梨Pyrus bretschneideri ‘Xuehuali’×P.pyrifolia ‘Shinsseiki’和黄金梨P.pyrifolia‘Niitaka’×P.pyrifolia‘Nijisseiki’的叶片进行Illumina Hi SeqTM2000高通量转录组测序分析,利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库分析2个梨品种中的差异表达基因(DEGs).[结果]2个梨品种间在正常浇水和干旱处理下分别发现了4 377和3 841个DEGs,其中只在干旱处理下的DEGs有1 340个.这些DEGs在GO数据库的3个本体生物过程、分子功能和细胞成分中富集到的数量分别是1 387、922和1 253个,与植物抗旱相关的代谢过程、应激反应和生物膜等条目分别富集到349、139和151个DEGs.仅在干旱处理下的1 340个DEGs被比对到102个KEGG代谢通路上,其中与植物内源激素相关的代谢通路有3个.将1 340个DEGs进行转录因子分析发现,被注释为转录因子的有37个,分布在17个转录因子家族中,其中乙烯应答转录因子(ERF)家族所拥有的DEGs最多,为11个.[结论]本研究发现了与梨抗旱相关的内源激素代谢基因和转录因子,干旱胁迫下这些基因在2个梨品种中差异表达,这可能与2个品种的抗旱性差异存在密切关系,为下一步梨抗旱分子机理研究奠定了基础.
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文献信息
篇名 干旱处理下2个梨品种转录组差异表达基因分析
来源期刊 华南农业大学学报 学科 农学
关键词 干旱 转录组 差异表达基因 代谢通路 转录因子
年,卷(期) 2018,(4) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 61-67
页数 7页 分类号 S661.2
字数 4268字 语种 中文
DOI 10.7671/j.issn.1001-411X.2018.04.010
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 徐小牛 安徽农业大学林学与园林学院 107 1235 18.0 30.0
2 朱立武 安徽农业大学果树学重点实验室 110 1099 19.0 27.0
3 王华 安徽农业大学果树学重点实验室 23 101 6.0 9.0
4 汪王微 安徽农业大学果树学重点实验室 3 5 1.0 2.0
5 王巧巧 安徽农业大学果树学重点实验室 2 2 1.0 1.0
6 刘春旖 安徽农业大学果树学重点实验室 1 1 1.0 1.0
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华南农业大学学报
双月刊
1001-411X
44-1110/S
大16开
广州五山华南农业大学学报编辑部
1959
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