美洲南瓜α-微管蛋白CpTUA基因的分离及其作为内参基因的应用

• 作者: 刘建汀 叶新如 朱海生 李永平 林珲 温庆放 温文旭 王彬 陈敏氡
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: 美洲南瓜 内参基因 α-微管蛋白 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 2040-2050
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2018.12.0197

摘要

为了获得美洲南瓜α-tubulin基因,并设计合适的荧光定量PCR内参引物,该研究通过转录组测序和RT-PCR方法获得了1条长达1 863 bp的cDNA,命名为CpTUA,GeneBank登录号为:MH310440.生物信息学分析表明,该序列包含1个开放读码框(open reading frame,ORF),大小为1353 bp,预测共编码450个氨基酸,理论分子大小约为49.57 kDa,蛋白质等电点为4.84. Motif Scan分析显示,CpTUA蛋白质的氨基酸序列49-246位和248-393位分别为Tubulin和Tubulin-C保守区域.同源性分析表明,基因编码的蛋白质与同为南瓜属的中国南瓜和印度南瓜同源蛋白的相似性达到99％,具有高度的保守性.在此基础上,设计了1对的荧光定量PCR引物,该引物具有较高的特异性和重复性.RT-PCR和qRT-PCR分析表明,CpTUA基因在美洲南瓜不同组织和不同胁迫处理下均能稳定表达,适合在美洲南瓜基因表达研究中作为内参基因.该研究为开展美洲南瓜重要功能基因的表达模式和调控机制的研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李永平		64	330	11.0	15.0
2	温庆放		108	864	14.0	25.0
3	朱海生		53	277	10.0	14.0
4	林珲		33	137	8.0	11.0
5	刘建汀		15	5	1.0	2.0
6	温文旭		2	4	1.0	2.0
7	叶新如		8	4	1.0	2.0
8	王彬		18	5	1.0	2.0
9	陈敏氡		23	23	2.0	4.0