植物鸟氨酸脱羧酶家族基因鉴定及进化分析

• 作者: 王鹏 盖江涛 罗朝鹏
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 鸟氨酸脱羧酶 精氨酸脱羧酶 基因家族 进化
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 96-101
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.016.000096

摘要

精氨酸脱羧酶(ADC)和鸟氨酸脱羧酶(ODC)共同负责腐胺的合成,而烟草等茄科植物中,因为腐胺是尼古丁的前体,ADC、ODC对于尼古丁合成具有特殊意义.为系统梳理ODC和ADC在植物基因组中的状况,我们对其基因进行了全面的鉴定和进化分析,并重点考察了其在茄科植物番茄中的表达.首先,我们从已阐明功能的ADC和ODC蛋白序列中,均鉴定了两个保守结构域;在此基础上,结合HMMER和BLAST,从10个植物基因组中共鉴定得到了46个鸟氨酸脱羧酶家族基因.对其构建进化树,发现它们分成3个亚家族:ODC、ADC和DapDc;这些基因均为脱羧酶基因.人类和酵母基因均聚在ODC这一枝,表明ODC在本家族中进化最早.拟南芥和苔藓中均不存在ODC基因,表明此基因在这两个植物基因组中发生了丢失.ADC基因在植物登陆后才得以进化形成.DapDc基因数目极为保守,表明它在植物进化过程中受到了严格的控制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王鹏		18	24	4.0	4.0
2	罗朝鹏		2	0	0.0	0.0
3	盖江涛		2	0	0.0	0.0