亚麻芥未成熟胚中磷脂酶基因家族的转录组学分析

• 作者: 张百兵 戢舒涵 李晓薇 李海燕 王法微 赵旭
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 亚麻芥 转录组 磷脂酶 基因 代谢通路
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 793-800
• 页数: 8页
• 分类号: S565.9
• 字数: 3767字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2018.06.008

摘要

为了解磷脂酶基因家族在亚麻芥胚中的表达情况,本研究基于454测序技术对亚麻芥花后10d(DAF10)和花后20d(DAF20)的胚中磷脂酶基因家族进行筛选和分析.测序结果表明,DAF10样本和DAF20样本分别获得有效序列521 507个和310 125个,序列长度主要分布在341～560 bp,序列组装分别获得25 398个和23 678个Unigene,Unigene平均长度分别为630 bp和654 bp.在此基础上,筛选两个样本全部Unigene,共获得磷脂酶基因36个,其中属于磷脂酶A1基因4个、磷脂酶A2基因9个、磷脂酶C基因10个、磷脂酶D基因13个.Pathway基因功能注释显示,PLA1的4个候选基因没有注释到任何代谢通路上;PLA2中只有候选基因Unigene19110被成功注释,它在植物中主要参与甘油磷脂代谢途径和醚酯代谢途径.PLC家族中只有4个候选成员Unigene443、Unigene8071、Unigene8213和Unigene7311被成功注释,它们除参与甘油磷脂代谢和醚酯代谢之外,还在肌醇磷酸代谢途径中发挥重要作用.而PLD家族中除Unigene18630、Unigene17966和Unigene441没有代谢通路注释信息外,其他的10个成员,也都只在甘油磷脂代谢途径和醚酯代谢途径有作用.