青藏高原特有种—藏扇穗茅叶绿体基因组测序及序列分析

• 作者: 刘涛 刘玉萍 吕婷 周勇辉 朱迪 苏旭
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 禾本科 扇穗茅属 藏扇穗茅 叶绿体基因组 Illumina测序 系统分析 青藏高原
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 518-525
• 页数: 8页
• 分类号: Q949.71
• 字数: 5397字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.04.005

摘要

藏扇穗茅(Littledalea tibetica)是禾本科(Poaceae)雀麦族(Bromeae)中一个具有重要生态价值的多年生高山特有种,主要分布于青藏高原及其毗邻地区.本文采用基于第二代高通量测序平台的Illumina MiSeq技术,对青藏高原特有种—藏扇穗茅进行了叶绿体基因组测序,首次建立了雀麦族物种的标准测序流程;同时,以其近缘物种—黑麦草(Lolium perenne)的叶绿体基因组序列作为参考,组装获得它的叶绿体基因组序列.结果表明,藏扇穗茅叶绿体基因组序列全长136 852 bp,GC含量为38.5％,呈典型的四段式结构,其中大(LSC)、小(SSC)单拷贝区大小分别为80 970和12 876 bp,反向互补重复区(IR)大小为21 503 bp,共注释得到141个基因,包含95个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因,主要分布于大单拷贝区和小单拷贝区.同时,基于藏扇穗茅和其它30种禾本科植物叶绿体基因全序列构建的系统发育树显示,藏扇穗茅与早熟禾亚科中小麦族植物亲缘关系较近.