黄皮叶绿体基因组测序与分析

• 作者: 罗睿雄 赵志常 高爱平 黄建峰
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄皮 叶绿体基因组 测序与分析
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 115-118
• 页数: 4页
• 分类号: S667.9
• 字数: 3178字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2019.11.032

摘要

[目的]分析黄皮[Clausena lansium(Lour.)Skeels)]叶绿体基因组,为黄皮属不同种或品种的进化、杂交、演变,以及黄皮不同品种的鉴定等提供技术支持.[方法]使用试剂盒提取了黄皮的叶绿体DNA,通过测序、组装、注释获得了黄皮叶绿体基因组.[结果]黄皮叶绿体基因组全长159283 bp,其中反相重复序列区(IRs)长53998 bp,大单拷贝序列区(LSC)和小单拷贝序列区(SSC)长度分别为87301、17983 bp,共注释126个基因,包括编码蛋白基因89个,tRNA基因29个和rRNA基因8个.黄皮叶绿体基因组全序列GC含量38.7％.对5种芸香科果树的全长序列、SSC、LSC、IRA、IRB进行比较分析发现,假黄皮的叶绿体全长序列、LSC、IRA、IRB区域的长度较其他4种果树长,柠檬的SSC区域长度最长,黄皮的全长序列和SSC区域长度最短.黄皮叶绿体的基因数目和编码蛋白数目较其他4种果树多.对20种园艺植物的叶绿体基因组进行分析发现,同一科下面的不同属植物或同一属下面的不同种更容易聚为一类.[结论]该研究丰富了热带果树的叶绿体基因组数据库,为种质资源的合理开发利用提供了依据.