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摘要:
目的 利用生物信息学方法对男女肌肉衰减综合征患者与正常人群进行差异基因分析,研究肌肉衰减个体骨骼肌细胞基因表达在性别间的差异.方法 从Gene Expression Omnibus数据库下载老年肌肉衰减综合征相关数据集,采用BRB-Array Tools及STRING软件在线分析,利用Cytoscape软件进行蛋白质相互作用网络分析.结果 男性差异表达基因219个,其中高表达152个,低表达67个;女性差异表达基因142个,其中高表达90个,低表达52个;共同高表达47个,共同低表达21个.基因本体(GO)分析显示,女性肌肉衰减综合征患者差异基因涉及的GO类别较多,共同的富集模块为脂肪细胞的分化调节、蛋白激酶抑制剂活性、蛋白激酶调节剂活性等.抗肌萎缩蛋白、波形蛋白和原肌球蛋白α-3链是男性蛋白质相互作用网络中重要节点,而金属硫蛋白1H、动力蛋白轻链为女性的重要节点.结论 老年肌肉衰减综合征发生机制存在性别差异.针对各自重要节点的后续研究可能对老年肌肉衰减综合征的发生机制及并发症的研究起重要作用.
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文献信息
篇名 老年肌肉衰减综合征基因表达性别差异的生物信息学分析
来源期刊 中国康复理论与实践 学科 医学
关键词 肌肉衰减综合征 老年 性别 蛋白质相互作用网络 生物信息学
年,卷(期) 2018,(3) 所属期刊栏目 专题 肌肉衰减综合征与肌萎缩
研究方向 页码范围 249-255
页数 7页 分类号 R685
字数 3271字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1006-9771.2018.03.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 徐平 上海中医药大学针灸推拿学院 90 448 12.0 17.0
2 虎力 上海中医药大学针灸推拿学院 41 128 8.0 9.0
3 陈健 上海中医药大学中医复杂系统研究中心 7 55 3.0 7.0
4 寿崟 上海中医药大学针灸推拿学院 9 23 2.0 4.0
5 张伟波 上海中医药大学针灸推拿学院 10 17 2.0 4.0
6 高原 上海中医药大学针灸推拿学院 11 24 2.0 4.0
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研究主题发展历程
节点文献
肌肉衰减综合征
老年
性别
蛋白质相互作用网络
生物信息学
研究起点
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引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国康复理论与实践
月刊
1006-9771
11-3759/R
大16开
北京丰台区角门北路10号
82-35
1995
chi
出版文献量(篇)
7855
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