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qPCR快速检测金黄色葡萄球菌及MRSA方法的建立及评价
qPCR快速检测金黄色葡萄球菌及MRSA方法的建立及评价
作者:
何玥
刘和录
刘琼
李玉霞
梁鸿
窦宇红
马彩凤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
金黄色葡萄球菌
MRSA
atl基因
mecA基因
精准诊断
qPCR
摘要:
目的 建立qPCR法快速检测金黄色葡萄球菌及其mecA基因,以期快速精准诊断金黄色葡萄球菌感染及初步判断耐药情况.方法 从NCBI数据库下载金黄色葡萄球菌nuc、atl、icaB、fnbA、hla、srap基因序列用于鉴定标志筛选,mecA基因序列用于MRSA标志筛选;经DNA MAN比对后,选择各基因保守区分别设计1~2套引物、探针,建立单重及双重qPCR,用临床分离株及标准菌株筛选出检测性能最好的基因片段作为检测标志物,建立金黄色葡萄球菌鉴定和耐药双重qPCR检测方法,并进行性能评价.结果 经筛选,金黄色葡萄球菌atl基因(CP009361.1:1010217~1010341)、mecA基因(KF058908.1:1715~1843)两片段检测性能最优,将其作为标志物建立双重qPCR法.该方法的检测下限均低至4 copies/反应;扩增线性范围均达2.0×102~8 copies/mL.335份金黄色葡萄球菌(含94份MRSA)培养阳性的患者样本中,qPCR法分别检出SA 335份,MRSA 94份;95份金黄色葡萄球菌培养阴性的患者样本中,qPCR法分别检出SA 17份,MRSA 4份,经PCR产物测序,与标准菌株同源性均≥90%.双重qPCR法从样品处理到报告结果≤2.0 h.结论 qPCR法方法简便、快速、灵敏度高、特异性好,可望提高金黄色葡萄球菌感染的诊断能力并实现快速检测,为尽早精准治疗赢得时间.
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篇名
qPCR快速检测金黄色葡萄球菌及MRSA方法的建立及评价
来源期刊
中国感染控制杂志
学科
医学
关键词
金黄色葡萄球菌
MRSA
atl基因
mecA基因
精准诊断
qPCR
年,卷(期)
2018,(9)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
764-769
页数
6页
分类号
R378.1+1
字数
4161字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1671-9638.2018.09.003
五维指标
作者信息
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何玥
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精准诊断
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国感染控制杂志
主办单位:
中南大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1671-9638
CN:
43-1390/R
开本:
16开
出版地:
湖南省长沙市湘雅路87号
邮发代号:
42-203
创刊时间:
2002
语种:
chi
出版文献量(篇)
3636
总下载数(次)
6
总被引数(次)
29565
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