DNA重复序列鉴定陕西省利什曼原虫

• 作者: 关蓉晖 刘东立 张铮 李文涓 李欣妍 王凤萍 王天海 王安礼 石一
• 来源期刊: 中国寄生虫学与寄生虫病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 利什曼原虫 DNA重复序列 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 271-274
• 页数: 4页
• 分类号: R382.22
• 语种: 中文

摘要

提取陕西省韩城市犬源利什曼原虫分离株(1份)、病犬骨髓(1份)、患者骨髓(3份)和白蛉(2份)共7份样品的利什曼原虫DNA,PCR扩增DNA重复序列,扩增产物经毛细管电泳后进行双向测序.采用DNAstar SeqMan软件进行序列拼接,与国内外发表的DNA重复序列进行比对,分析同源性,并用邻接法(NJ)构建系统进化树.结果7份利什曼原虫DNA样品均扩增出260 bp左右的条带,与目的序列大小一致,且测序结果完全相同.序列比对结果显示,7条DNA重复序列与参考序列的婴儿利什曼原虫(GenBank登录号为L42486)、杜氏利什曼原虫(GenBank登录号为L42486)仅1个碱基的差异.同源性分析结果显示,同种原虫序列相似性大于90％,个别达100％.系统进化树结果显示,7条序列与杜氏利什曼原虫、婴儿利什曼原虫聚为一支.结合流行病学资料,陕西韩城利什曼原虫为婴儿利什曼原虫.