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摘要:
通过同源比对查找GAPDH基因的保守区,运用逆转录PCR、同源克隆及cDNA末端快速克隆(rapid-ampli-fication of cDNA ends,RACE)等技术从当归中克隆GAPDH基因的全长cDNA序列,利用生物信息学分析工具对该基因编码蛋白的基本性质、结构特点及生物学功能进行初步预测,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析当归GAPDH基因的表达稳定性.结果表明,克隆得到当归GAPDH基因cDNA全长序列为1345个核苷酸,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1005 bp,3'UTR和5'UTR长度分别为268 bp和72 bp,共编码334个氨基酸,该基因命名为AsGAPDH.AsGAPDH基因编码蛋白的预测相对分子质量为36.3 kD,理论等电点为7.06,为亲水性非分泌型蛋白,与伞形科植物白芹的亲缘关系最近.AsGAPDH基因在当归根、叶柄及叶中的表达量相近且稳定性好,扩增特异性强.
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文献信息
篇名 当归甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的克隆及组织稳定性分析
来源期刊 河南农业大学学报 学科 农学
关键词 当归 GAPDH基因 克隆 序列分析 实时荧光定量PCR
年,卷(期) 2018,(6) 所属期刊栏目 生命科学
研究方向 页码范围 943-950
页数 8页 分类号 S567.23
字数 4846字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王引权 甘肃中医药大学药学院 51 322 10.0 16.0
2 王振恒 甘肃中医药大学药学院 28 81 5.0 8.0
3 杨雪 甘肃中医药大学药学院 12 5 2.0 2.0
4 夏琦 甘肃中医药大学科研实验中心 17 89 6.0 9.0
5 雒军 甘肃中医药大学科研实验中心 20 40 4.0 5.0
6 杨彩霞 甘肃中医药大学药学院 7 3 1.0 1.0
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GAPDH基因
克隆
序列分析
实时荧光定量PCR
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期刊影响力
河南农业大学学报
双月刊
1000-2340
41-1112/S
大16开
郑州文化路95号
36-132
1960
chi
出版文献量(篇)
3112
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6
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30505
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