文冠果LEC1基因的克隆及表达分析

• 作者: 杨琦 王俊秀 路蒙蒙 郭惠红 韩硕
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 文冠果 LEC1 基因克隆 序列分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 8-16
• 页数: 9页
• 分类号: Q78|S718.46
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.1000-1522.20170314

摘要

[目的]文冠果隶属无患子科,是我国北方重要的油料树种,种子含油量高,是制备食用油、生物柴油等的优质原料.本研究旨在克隆文冠果Leafy Cotyledon 1(XsLEC1)基因,进行序列及表达模式的分析.[方法]以文冠果种胚为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆文冠果LEC1基因.采用Protparam及TMHMM2.0软件预测XsLEC1蛋白的理化性质和跨膜结构域,ProtComp9.0及Motif Scan软件预测XsLEC1蛋白的亚细胞定位及蛋白功能,BioEdit及MEGA7软件分析XsLEC1蛋白的多重序列比对和进化关系.运用RT-PCR和实时荧光定量PCR分析XsLEC1基因的表达模式.[结果]XsLEC1 cDNA全长1035 bp,包含一个长度为690 bp的开放阅读框(GenBank号为MF616360),可编码229个氨基酸.推导的氨基酸序列包含一个HAP3亚基的保守功能域B.该保守功能域内含有组蛋白折叠中的3个 α 螺旋(α1、α2、α3)和两个短环结构(L1、L2).在线预测该蛋白为稳定的,亲水性蛋白,无信号肽和跨膜区域,定位于细胞核,存在多个磷酸化位点.二级结构主要由 α 螺旋和无规则卷组成.进化分析表明,该蛋白序列与同科龙眼亲缘关系最近,其次为麻风树和毛果杨.RT-PCR实验得出,XsLEC1基因在文冠果的根、茎、叶及花中均无表达,在种子中出现较高表达.实时荧光定量PCR结果进一步显示,XsLEC1基因在种胚中有明显的时序表达特性,在种胚发育的前期(花后33、40、47 d)表达较高,在种胚发育的后期(花后54、61、68 d)表达较低,至花后75 d时仅有微量表达,而在完全成熟的种胚(花后81 d)中未检测到XsLEC1的表达.[结论]文冠果LEC1基因的克隆及表达分析,为以后深入研究XsLEC1的功能奠定了分子基础,同时对生产实践中文冠果油脂品质的改良有一定的实践意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭惠红	北京林业大学生物科学与技术学院	29	371	10.0	18.0
2	路蒙蒙	北京林业大学生物科学与技术学院	2	7	2.0	2.0
3	韩硕	北京林业大学生物科学与技术学院	2	7	2.0	2.0
4	杨琦	北京林业大学生物科学与技术学院	2	3	1.0	1.0
5	王俊秀	北京林业大学生物科学与技术学院	3	7	2.0	2.0