半枝莲转录组高通量测序及黄酮类相关基因解析

• 作者: 刘昌勇 李珍 林泽燕 邹毅辉
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 医学
• 关键词: 半枝莲 转录组测序 差异表达 黄酮 生物合成
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 1242-1250
• 页数: 9页
• 分类号: R282
• 字数: 3965字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.12.003

摘要

半枝莲为我国传统中药,具有重要的经济价值,但分子基础研究滞后,在一定程度上限制了其资源利用与开发.本研究利用Illumina HiSeq X Ten技术平台对半枝莲进行了转录组测序,通过de novo组装,获得125 823个unigene,N50长度826 bp、平均长度586 bp,并有74 185个unigene得到注释.半枝莲地上部分对地下部分差异表达unigene有14 832个,其中上调表达6 941个,下调表达7 891个;推测差异unigene多集中于植物-病原菌互作、淀粉和蔗糖代谢以及苯丙素生物合成等代谢途径.利用KEGG数据库挖掘出89个半枝莲黄酮类生物合成途径相关unigene,其中差异表达unigene 36个.半枝莲地上部分与地下部分差异基因分析中,黄酮类化合物合成途径的重要酶都有明显的下调表达,推测半枝莲的黄酮类化合物合成器官是地上部分,其主要的药用部位是茎叶.黄酮类的关键酶研究结果为半枝莲分子生物学研究奠定基础,为半枝莲药用活性成分的生物合成调控、品质改良、品种选育等提供参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘昌勇	国家林业局管理干部学院	9	33	4.0	5.0
2	邹毅辉	漳州卫生职业学院药学系	5	6	2.0	2.0
3	林泽燕	漳州卫生职业学院药学系	7	11	3.0	3.0
4	李珍	漳州卫生职业学院药学系	2	4	1.0	2.0